Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp13P33435 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms