Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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