Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc5P32043 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc5P32043 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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