Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd28P31041 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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