Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msr1P30204 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msr1P30204 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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