Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VtnP29788 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VtnP29788 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VtnP29788 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VtnP29788 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VtnP29788 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VtnP29788 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VtnP29788 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VtnP29788 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VtnP29788 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VtnP29788 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VtnP29788 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VtnP29788 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VtnP29788 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VtnP29788 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VtnP29788 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VtnP29788 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VtnP29788 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms