Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms