Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dusp1P28563 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms