Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd10P28359 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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