Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CftrP26361 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CftrP26361 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CftrP26361 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CftrP26361 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CftrP26361 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CftrP26361 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CftrP26361 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CftrP26361 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CftrP26361 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CftrP26361 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CftrP26361 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CftrP26361 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CftrP26361 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CftrP26361 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CftrP26361 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CftrP26361 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CftrP26361 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CftrP26361 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CftrP26361 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CftrP26361 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CftrP26361 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CftrP26361 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CftrP26361 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CftrP26361 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CftrP26361 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CftrP26361 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CftrP26361 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CftrP26361 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CftrP26361 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CftrP26361 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CftrP26361 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CftrP26361 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CftrP26361 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CftrP26361 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CftrP26361 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CftrP26361 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CftrP26361 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CftrP26361 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CftrP26361 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CftrP26361 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CftrP26361 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CftrP26361 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CftrP26361 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CftrP26361 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CftrP26361 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CftrP26361 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CftrP26361 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CftrP26361 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CftrP26361 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CftrP26361 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CftrP26361 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CftrP26361 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms