Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HdcP23738 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HdcP23738 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HdcP23738 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HdcP23738 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HdcP23738 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HdcP23738 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HdcP23738 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HdcP23738 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HdcP23738 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HdcP23738 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HdcP23738 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HdcP23738 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HdcP23738 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HdcP23738 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HdcP23738 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HdcP23738 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HdcP23738 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HdcP23738 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HdcP23738 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdcP23738 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdcP23738 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdcP23738 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdcP23738 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdcP23738 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdcP23738 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdcP23738 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdcP23738 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HdcP23738 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HdcP23738 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HdcP23738 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdcP23738 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdcP23738 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdcP23738 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdcP23738 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdcP23738 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdcP23738 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdcP23738 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HdcP23738 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HdcP23738 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HdcP23738 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HdcP23738 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms