Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P20040 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P20040 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P20040 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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