Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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