Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a1P19437 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121 ms