Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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