Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa-rs1P17533 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms