Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhoP15409 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoP15409 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RhoP15409 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhoP15409 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
RhoP15409 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhoP15409 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhoP15409 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhoP15409 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
RhoP15409 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhoP15409 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhoP15409 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhoP15409 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RhoP15409 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RhoP15409 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms