Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd44P15379 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms