Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms