Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa1P11477 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms