Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

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Length 679 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fv4P11370 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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