Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP11369 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP11369 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP11369 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms