Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prf1P10820 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms