Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms