Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnfP06804 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnfP06804 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms