Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01788 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01788 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01788 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01788 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01788 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01788 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01788 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01788 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01788 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01788 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01788 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01788 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01788 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01788 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01788 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P01788 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01788 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01788 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01788 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01788 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms