Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms