Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casp8O89110 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casp8O89110 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casp8O89110 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms