Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JtbO88824 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JtbO88824 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms