Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BlmO88700 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BlmO88700 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BlmO88700 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BlmO88700 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BlmO88700 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BlmO88700 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BlmO88700 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BlmO88700 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BlmO88700 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BlmO88700 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BlmO88700 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BlmO88700 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BlmO88700 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BlmO88700 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BlmO88700 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BlmO88700 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BlmO88700 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BlmO88700 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BlmO88700 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms