Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shoc2O88520 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shoc2O88520 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shoc2O88520 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shoc2O88520 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shoc2O88520 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shoc2O88520 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shoc2O88520 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shoc2O88520 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shoc2O88520 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shoc2O88520 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shoc2O88520 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shoc2O88520 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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