Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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