Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col5a1O88207 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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