Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stra6O70491 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stra6O70491 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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