Protein–RNA interactions for Protein: O70194

Eif3d, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3dO70194 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3dO70194 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms