Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3aO70157 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3aO70157 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3aO70157 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3aO70157 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3aO70157 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top3aO70157 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Top3aO70157 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3aO70157 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Top3aO70157 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3aO70157 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top3aO70157 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3aO70157 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3aO70157 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3aO70157 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3aO70157 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Top3aO70157 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms