Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cbx4O55187 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cbx4O55187 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cbx4O55187 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cbx4O55187 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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