Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms