Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChkaO54804 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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