Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
DffbO54788 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DffbO54788 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffbO54788 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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DffbO54788 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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DffbO54788 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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DffbO54788 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffbO54788 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffbO54788 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms