Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FxnO35943 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FxnO35943 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FxnO35943 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms