Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek2O35942 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek2O35942 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek2O35942 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek2O35942 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek2O35942 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek2O35942 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek2O35942 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek2O35942 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek2O35942 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek2O35942 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek2O35942 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek2O35942 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek2O35942 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek2O35942 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms