Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Lhx8O35652 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Lhx8O35652 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Lhx8O35652 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gm20914-202ENSMUST00000188887 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx8O35652 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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