Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc1a6O35544 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Slc1a6O35544 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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