Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc27a2O35488 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc27a2O35488 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Slc27a2O35488 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Slc27a2O35488 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Slc27a2O35488 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Slc27a2O35488 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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