Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Edil3O35474 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edil3O35474 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edil3O35474 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edil3O35474 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms