Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms