Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Nedd9O35177 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Nedd9O35177 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Nedd9O35177 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Nedd9O35177 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Nedd9O35177 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Nedd9O35177 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Nedd9O35177 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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