Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx3O35160 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms