Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms